Структура полученного HDNNP показана на рисунке для тройной системы, содержащей элементы A, B и C.
На практике оказалось наиболее эффективным создание HDNNP с несколькими различными архитектурами NN.
Анализируя результаты можно выбрать наилучший потенциала для приложение.
Типичные HDNNP содержат от ста до трехсот скрытых слоев и до 5 тыс нейронов на слой.